Hace unos días me encontré con este problema. Fue después de actualizar Java a su versión más actual. Al ir a realizar un commit desde NetBeans 8.1 a un repositorio Subversion me devolvió este error, y claro, no pude realizar el commit.
Después de mucho indagar en el problema encontré que el JDK 1.8 ha abandonado el cifrado RC4 por inseguro, que es el cifrado que utilizaba el servidor donde tengo el repositorio. Así que como no tengo acceso al servidor, lo más adecuado es instalar la versión 1.7 de JDK y modificar NetBeans para que utilice esa versión.
Para indicarle a NetBeans la versión de JDK que debe usar debemos buscar un archivo llamado netbeans.conf, que habitualmente estará en el siguiente directorio:
C:\Program Files\NetBeans 8.x\etc\netbeans.conf
En ese archivo hay que buscar la variable netbeans_jdkhome y añadir la ruta de la versión del JDK:
netbeans_jdkhome="C:\Program Files\Java\jdk1.7xxxxx"
En mi caso ya tenía instalada la versión 1.7 de JDK, si tu no la tuvieras tendrás que instalarla primero
Guardamos el archivo, abrimos NetBeans y volvemos a hacer ese commit que se resistía.
